La terapia HAART frecuentemente es capaz por sí sola de controlar infecciones previamente refractarias a tratamiento, como por ejemplo la candidiasis oral resistente a azoles, molusco contagioso, criptosporidiosis y microsporidiasis, entre otras. También se han observado remisiones a largo plazo de infecciones como citomegalovirus - CMV - y Mycobacterium Avium Complex - MAC -, lo que ha conducido a suspender tratamientos profilácticos.
