Se utiliza a modo de prueba diagnóstica, permite la extracción de biopsias y la realización de terapéutica endoscópica.
La colonoscopia se puede usar por las siguientes razones:
- Dolor abdominal, cambios en las deposiciones o pérdida de peso
- Cambios anormales (como pólipos) hallados en una sigmoidoscopia o en exámenes radiográficos (tomografía computarizada o enema opaco)
- Anemia debido al bajo nivel de hierro (por lo regular cuando no se ha encontrado ninguna otra causa)
- Sangre en las heces o heces negras o alquitranosas
- Seguimiento de un hallazgo previo, como pólipos o cáncer de colon
- Enfermedad intestinal inflamatoria (colitis ulcerativa y enfermedad de Crohn)